教育背景 2009.09-2013.07 东北林业大学 信息与计算机工程学院 学士 2013.09-2015.07 吉林大学 计算机科学与技术学院 硕士 2015.09-2018.12 吉林大学 计算机科学与技术学院 博士
工作经历 2019.03-2019.06 香港科技大学高等研究院 博士后 2019.07-2021.08 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 博士后 2021.09-至今 东华大学人工智能研究院 讲师
出访及挂职经历 2016.02-2018.07 美国佐治亚大学生物信息学系 联合培养
研究方向 医疗影像 大数据挖掘 多模态融合 生物信息学 科研项目 1.上海市项目,上海市超级博士后计划-左春满,2020.01-2022.12,主持 2.中科院项目,基于多组学数据的健康人群临界状态识别与疾病预警,2020.01-2024.12,主要参与 3.国家自然科学基金,基于时序高维数据的流感个体生物标记物研究,2019.01-2021.12,参与 4.上海市青年科技英才扬帆计划,基于深度学习开发单细胞多组学集成方法预测胆囊癌演变的基因调控网络,2022.04-2025.03,在研,主持 5.中央高校基本科研业务费专项资金项目,基于单细胞多组学集成方法预测胆囊癌演变的调控网络研究,2022.01-2024.12,在研,主持 6.国家自然科学基金委员会重点项目,单细胞多组学数据集成分析理论与方法,2022.01-2026.12,在研,参与 7.国家自然科学基金委员会重点项目,基于多模态数据的健康临界状态的数学刻画与预警理论,2022.01-2026.12,在研,参与 8.中国科学院项目,基于多组学数据的健康人群临界状态识别与疾病预警,2020.01-2024.12,在研,参与
代表性论文专著 [1] Chunman Zuo*, Yijian Zhang, Chen Cao, Jinwang Feng, Mingqi Jiao, Luonan Chen*. Elucidating tumor heterogeneity from spatially resolved transcriptomics data by multi-view graph collaborative learning [J]. Nature Communications.2022, 13(1): 5962. [2] Yijian Zhang#, Chunman Zuo#, Liguo Liu#, …, Luonan Chen*, Yingbin Liu*. Single-cell RNA-Sequencing Atlas Reveals an MDK-Dependent Immunosuppressive Environment in ErbB Pathway-Mutated Gallbladder Cancer[J]. Journal of Hepatology. 2021,75(5): 1128-1141. [3] Chunman Zuo, Hao Dai, Luonan Chen*. Deep cross-omics cycle attention model for joint analysis of single-cell multi-omics data[J]. Bioinformatics. 2021, 37(22): 4091-4099. [4] Chunman Zuo, Luonan Chen*. Deep-joint-learning analysis model of single cell transcriptome and open chromatin accessibility data[J]. Briefings in Bioinformatics. 2021, 22(4): bbaa287. [5] Chunman Zuo, Blow Matthew, Avinash Sreedasyam, …, Ying Xu*. Revealing the transcriptomic complexity of switchgrass by PacBio long-read sequencing[J]. Biotechnology for Biofuels.2018, 11(1): 1-15. [6] Jie Xia, Lequn Wang, Guijun Zhang*, Chunman Zuo*, Luonan Chen. RDAClone: Deciphering Tumor Heterozygosity through Single-Cell Genomics Data Analysis with Robust Deep Autoencoder [J]. Genes. 2021, 12(12): 1847. [7] Chunman Zuo, Yuhong Tang, Hao Fu, …, Ying Xu*. Elucidation and Analyses of the Regulatory Networks of Upland and Lowland Ecotypes of Switchgrass in Response to Drought and Salt Stresses[J]. PLOS ONE. 2018, 13(9): e0204426. [8] Qiqi Jin, Chunman Zuo, Haoyue Cui, …, Hao Dai*, Luonan Chen*. Single-cell entropy network detects the activity of immune cells based on ribosomal protein genes. Computational and Structural Biotechnology Journal,2022, 20: 3556–3566. [9] Jinwang Feng, Shaowu Zhang, Luonan Chen, Chunman Zuo. Detection of Alzheimer’s Disease Using Features of Brain Region-of-Interest-Based Individual Network Constructed with the sMRI Image [J]. Computerized Medical Imaging and Graphics. 2022, 98:102057. [10] Mingxin Tao, Tianci Song, Wei Du, Siyu Han, Chunman Zuo, et al. Classifying Breast Cancer Subtypes using Multiple Kernel Learning based on Omics Data. Genes. 2019, 10(3):200.
教学工作 本科生课程: 《数据技术与机器学习》
软件版权登记及专利 无
学术兼职 国际期刊Cell Research; Nature Communications; Briefings in Bioinformatics; PLOS Computational Biology; Genomics, Proteomics & Bioinformatics; IEEE/ACM TCBB; PLOS ONE审稿人
荣誉奖励 2022年 指导本科生参加2022年全国大学生数据分析大赛,获全国一等奖 香港科技大学 高等研究院博士后奖学金(2019) 2010-2012年,两次国家奖学金 |